付加価値税、各例費について：
総会社が別税コードを使用し、地方税務局に登録した直属組織を有する場合、直属組織が管理税務機関に付加価値税及び各例費を申告・納付する。
法人税について：
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総会社が非独立採算の組織を有する場合、総会社が非独立採算の組織の法人税をまとめて本社で申告・納付する。
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総会社が非独立採算の組織を有するが、当該組織が製造活動を行う場合、本社と製造組織の納税額を償却する。
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総会社が非独立採算の組織を有するが、当該組織が売上・費用・課税所得を計上できる場合又は独立採算の組織を有する場合、当該組織は直接管理税務機関に税金を申告・納付する。
